()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  ()  () ANOVA (1) Broodstock (2) CpG (1) CpG (1) DMCpG () DMR (1) DMR (1) DMRfind () DMS () GLM (1) Geoduck (3) HISAT2 (1) IGV () Mbias (1) MethylPy () PE () Point (3) Pt. (3) RNA (1) RNAseq (1) SE () Spawn (2) Strip (2) TrimGalore () URI (1) UTR () Whitney (3) admin (1) aligment (1) alignment () bedtools (1) bedtools (1) bin () bismark (1) bismark (1) bisulfite (1) broodstock (4) calcium (2) categories () cluster () core () destranded () development (1) end () feature () features () genome () genomic () geoduck (7) geoduck (7) gff () global () gonad (1) gonad (1) heatmap () hemolymph (3) histology (1) histology (1) imagej (1) intersectBed (1) juvenile (1) lice (2) local () loci () methods () methylation (1) methylation (1) multi-core () multicore () new () nextflow (1) nf-core (1) overlap () paired (1) persistent () promoter () proximity (1) putative () reproductive (1) reproductive-development (4) salmon (1) salmon (1) score () sea (2) sequencing (1) ship () silo (1) stats () stranded () threads () thresholding (1) track (1) trim () trimming ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

  ()

 ANOVA (1)

Fri. Mar 27, 2020 Geoduck new trim DMR analysis

 Broodstock (2)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 CpG (1)

Apr 22-Jun 7, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 CpG (1)

Apr 22-Jun 7, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 DMCpG ()

 DMR (1)

Jul 2-Aug 12 2020 Salmon + lice TxS DMRs

 DMR (1)

Jul 2-Aug 12 2020 Salmon + lice TxS DMRs

 DMRfind ()

 DMS ()

 GLM (1)

Thur. Mar. 12-20, 2020 Geoduck DMR stat analysis

 Geoduck (3)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 HISAT2 (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 IGV ()

 Mbias (1)

Mon. Mar. 16, 2020 Trimming Geoduck RRBS data

 MethylPy ()

 PE ()

 Point (3)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 Pt. (3)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 RNA (1)

Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR

 RNAseq (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 SE ()

 Spawn (2)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 Strip (2)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 TrimGalore ()

 URI (1)

Mon. May 11, Geoduck slides shipped to URI

 UTR ()

 Whitney (3)

Thurs. Mar 5, 2020 Geoduck Outreach in Pt. Townsend
Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up
Friday. Feb. 14, Point Whitney Strip Spawn

 admin (1)

Tues. Dec. 27, 2022 Changing my last name

 aligment (1)

Jun 12, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 alignment ()

 bedtools (1)

Tues. Apr 3-7, 2020 Geoduck DMR genome features

 bedtools (1)

Tues. Apr 3-7, 2020 Geoduck DMR genome features

 bin ()

 bismark (1)

Fri. Mar 19-27, 2020 Geoduck EPI Trimming Updated!

 bismark (1)

Fri. Mar 19-27, 2020 Geoduck EPI Trimming Updated!

 bisulfite (1)

Apr 22-Jun 7, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 broodstock (4)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR
Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 calcium (2)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay

 categories ()

 cluster ()

 core ()

 destranded ()

 development (1)

Thurs. Oct. 29, Geoduck qPCR

 end ()

 feature ()

 features ()

 genome ()

 genomic ()

 geoduck (7)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR
Thurs. Oct. 29, Geoduck qPCR
Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 geoduck (7)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR
Thurs. Oct. 29, Geoduck qPCR
Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 gff ()

 global ()

 gonad (1)

Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 gonad (1)

Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 heatmap ()

 hemolymph (3)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR

 histology (1)

Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 histology (1)

Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 imagej (1)

Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 intersectBed (1)

Aug 13-31 2020 Salmon + lice TxS Genomic Feature Analysis

 juvenile (1)

Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up

 lice (2)

May 24-Jun 3, 2020 Sea lice methylome
Apr 24-30, 2020 Sea lice methylome

 local ()

 loci ()

 methods ()

 methylation (1)

May 24-Jun 3, 2020 Sea lice methylome

 methylation (1)

May 24-Jun 3, 2020 Sea lice methylome

 multi-core ()

 multicore ()

 new ()

 nextflow (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 nf-core (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 overlap ()

 paired (1)

Apr 22-Jun 7, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 persistent ()

 promoter ()

 proximity (1)

Apr 15-16, 2020 DMCpG proximity for DMRs

 putative ()

 reproductive (1)

Thurs. Oct. 29, Geoduck qPCR

 reproductive-development (4)

Mon. Dec. 7, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Wed. Nov. 25, 2020 Hemolymph Calcium Assay
Oct 30-Nov 3, Geoduck Broodstock qPCR
Thur. July 16, Geoduck Broodstock Histology

 salmon (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 salmon (1)

Tues. Oct. 27, Salmon RNAseq

 score ()

 sea (2)

May 24-Jun 3, 2020 Sea lice methylome
Apr 24-30, 2020 Sea lice methylome

 sequencing (1)

Apr 22-Jun 7, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 ship ()

 silo (1)

Tues. Mar. 3, Point Whitney Silo Clean up

 stats ()

 stranded ()

 threads ()

 thresholding (1)

Jun 12, 2020 Re-process Salmon Methylome Data

 track (1)

Wed. Apr 8, 2020 Geoduck DMR genome features

 trim ()

 trimming ()